Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL7P80098 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCL7P80098 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms