Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF3P61204 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF3P61204 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms