Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms