Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUDT6P53370 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms