Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms