Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms