Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG3P32926 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG3P32926 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG3P32926 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG3P32926 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG3P32926 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms