Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms