Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms