Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTKP29376 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTKP29376 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTKP29376 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTKP29376 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTKP29376 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTKP29376 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTKP29376 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTKP29376 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LTKP29376 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LTKP29376 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTKP29376 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTKP29376 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms