Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCAP28676 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCAP28676 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCAP28676 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms