Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms