Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB5P28074 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB5P28074 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms