Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB4P28070 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms