Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKACBP22694 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms