Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSPP15924 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
DSPP15924 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSPP15924 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSPP15924 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSPP15924 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms