Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME1P15531 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME1P15531 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME1P15531 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms