Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI2P10070 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms