Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPA8P0DM63 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPA8P0DM63 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms