Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms