Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSP90AB1P08238 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms