Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFMP07197 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFMP07197 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms