Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOA1P02647 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms