Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms