Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX4O95219 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX4O95219 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms