Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNKO75909 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNKO75909 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNKO75909 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms