Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms