Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSVO60911 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSVO60911 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms