Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ABCC9O60706 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC9O60706 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms