Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms