Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDE6DO43924 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6DO43924 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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