Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms