Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP9BO43861 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms