Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXO3O43524 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO3O43524 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms