Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FABP7O15540 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FABP7O15540 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
FABP7O15540 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FABP7O15540 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FABP7O15540 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FABP7O15540 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FABP7O15540 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FABP7O15540 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ 0
FABP7O15540 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FABP7O15540 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FABP7O15540 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FABP7O15540 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FABP7O15540 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FABP7O15540 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FABP7O15540 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FABP7O15540 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FABP7O15540 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms