Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP290O15078 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP290O15078 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP290O15078 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP290O15078 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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