Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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