Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCER2I3L3R5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms