Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NPIPA5E9PKD4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms