Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms