Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B4DXG7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B4DXG7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms