Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRRM4A7MD48 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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