Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L3A6NE82 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms