Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms