Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms