Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG5Q9UPR3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms