Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSNQ9UPA5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSNQ9UPA5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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