Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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