Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms