Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms